به نقل از ایسنا متن این پیام به شرح ذیل است:

بسم الله الرّحمن الرّحیم

ملت سرافراز ایران!

چهلمین روز شهادت جمعی از هم میهنان عزیزمان، که در میان آنان سرداران با کفایت نظامی و دانشمندان برجسته ی هسته یی بودند، فرا رسید. این ضربه را گروه حاکم خبیث و جنایتکار صهیونی که دشمن رذل و عنود ملت ایران است وارد آورد. بیشک فقدان فرماندهانی چون شهیدان باقری و سلامی و رشید و حاجی زاده و شادمانی و دیگر نظامیان، و دانشمندانی چون شهیدان طهرانچی و عباسی و دیگر دانشمندان، برای هر ملتی سنگین است. اما دشمن ابله و کوته بین به هدف خود نرسید. آینده نشان خواهد داد که هر دو حرکت نظامی و علمی شتابنده تر از گذشته به سمت افقهای بلند پیش خواهد رفت انشاءالله.

شهیدان ما خود راهی را برگزیده بودند که گمان دستیابی به مرتبه ی والای شهادت در آن کم نبود و سرانجام به آنچه آرزوی همه ی فداکاران است رسیدند؛ بر آنان گوارا باد؛ امّا ناگواری آن برای ملت ایران بویژه خانواده های شهیدان و بویژه کسانی که آنان را از نزدیک می شناختند سخت و تلخ و سنگین است.

در این حادثه نقاط درخشانی را نیز بروشنی میتوان دید. اولاً تحمل و صبوری و استحکام روحیه ی بازماندگان که در نوع خود جز در تحولات جمهوری اسلامی ایران دیده نشده است. ثانیاً استقامت و ثبات دستگاههای زیر امر شهیدان، که نگذاشتند این ضربه ی سنگین، فرصت ها را سلب و در حرکت آنان وقفه ایجاد کند. و ثالثاً شکوهِ پایداریِ معجزه آسای ملت ایران که در اتحاد و استحکام روحی و عزم راسخ آنان بر ایستادگیِ یکپارچه در میدان به ظهور رسید. ایران اسلامی در این حادثه یک بار دیگر استواریِ بنیان خود را نشان داد. دشمنان ایران آهن سرد میکوبند.

ایران اسلامی به توفیق الهی روز به روز قویتر خواهد شد باذن الله.

مهم آن است که ما از این حقیقت، و از تکلیفی که از سوی آن بر دوش ماست غفلت نکنیم.

حفظ اتحاد ملی وظیفه ی یکایک ما است.

شتاب لازم در پیشرفت دانش و فناوری در همه ی بخش ها وظیفه ی نخبگان علمی است.

حفظ عزت و آبروی کشور و ملت، تکلیف بی اغماض گویندگان و قلم زنان است.

مجهز کردن روزافزون کشور با ابزارهای حراست از امنیت و استقلال ملی، وظیفه ی فرماندهان نظامی است.

جدیت و پیگیری و به نتیجه رساندن کارهای کشور وظیفه ی همه ی دستگاههای مسئول اجرایی است.

هدایت معنوی و نورانی کردن دلها و توصیه به صبر و سکینه و ثبات مردمی وظیفه ی حضرات روحانی است.

و حفظ شور و شوق و شعور انقلابی وظیفه ی یکایک ما و بویژه جوانان است. خدای عزیز رحیم همگان را موفق بدارد.

درود بر ملت ایران و سلام بر جوانان شهید، بر بانوان و کودکان شهید، و بر همه ی شهیدان و داغداران آنان.

والسلام علیکم و رحمهالله

سیّدعلی خامنه ای

3 مرداد